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BodBoge | 如何解決單細胞測序前的細胞質控?

發布(bu)時間:2023-04-04瀏覽(lan):540次

單(dan)細(xi)(xi)胞(bao)測(ce)序(xu)(single cell sequencing)是指先(xian)分(fen)(fen)離(li)純化單(dan)個細(xi)(xi)胞(bao),并提取該細(xi)(xi)胞(bao)的(de)DNA或RNA進行擴增(zeng)后測(ce)序(xu)的(de)技(ji)術。該技(ji)術廣(guang)泛(fan)應用于(yu)腫瘤、微(wei)生物學(xue)(xue)、神經科(ke)學(xue)(xue)等(deng)重要生命科(ke)學(xue)(xue)領域(yu),單(dan)細(xi)(xi)胞(bao)測(ce)序(xu)技(ji)術也逐漸(jian)成為了生命科(ke)學(xue)(xue)研究(jiu)的(de)熱點。相(xiang)(xiang)比于(yu)宏觀組(zu)織(zhi)樣品(pin)的(de)測(ce)序(xu),單(dan)細(xi)(xi)胞(bao)測(ce)序(xu)對于(yu)細(xi)(xi)胞(bao)和組(zu)織(zhi)的(de)異(yi)質性具(ju)有更(geng)加明確(que)的(de)分(fen)(fen)辯(bian),當然,難度也相(xiang)(xiang)對更(geng)高(gao)。

單細(xi)胞(bao)測序結合生(sheng)命科學研究領域的(de)應用,已逐(zhu)步向著(zhu)更高的(de)分辯能(neng)力(li)、靈敏度(du)、和更多的(de)維度(du)邁(mai)進(jin)。


什么是單細胞測序?

單細胞(bao)測序(xu)是基于高通(tong)量測序(xu)(NGS)方法,可(ke)檢測單細胞(bao)基因(yin)組、單細胞(bao)轉(zhuan)錄組、單細胞(bao)表觀基因(yin)組,提供(gong)細胞(bao)間差異的高分辨率視圖,從分子(zi)水平揭示(shi)細胞(bao)奧秘。


樣本要求

01、 樣(yang)本(ben)總量(liang)

制(zhi)備成單細胞(bao)懸浮液(ye),一個樣本的細胞(bao)起始量需大于1x105


02、 樣品濃(nong)度

最終上樣前細胞濃度在700-1200 cells/μL


03、 細胞活(huo)性(xing)

活細胞比率85%以上(shang)


04、  細胞大小(xiao)

直徑小于40μm


其(qi)它要(yao)求(qiu)

1-細(xi)胞培養基(ji)及(ji)緩沖液不能含有Ca2+Mg2+等(deng)影響酶活(huo)性(xing)的物質。

2-組織需解離成(cheng)(cheng)單細胞懸液,植物細胞需制成(cheng)(cheng)原生(sheng)質體。



為解決細胞(bao)計數準確性以及人(ren)工復核難的問題,博大博聚特推出(chu)一(yi)款全(quan)自動熒光細胞分析儀(JSY-FL-047"。儀器參照血球計數板計數規則,可實現人工比對儀器的計數結果。具有單(dan)細(xi)胞計數模式。為實驗用戶提供更可靠更高效的實驗解決方案。


全自動熒光(guang)細(xi)胞分析儀(yi)(JSY-FL-047)

1- 單(dan)細胞計數功能

儀器可(ke)識(shi)別出(chu)樣本中單個細胞所(suo)占比例聚團(tuan)細胞所(suo)占比例,適合(he)單細胞(bao)測序前對單個細胞(bao)的質控。


計數結果包含:總細胞數量、總細胞濃度、團聚活細胞團數(shu)(濃(nong)度-比率)單個活細胞數量(濃度-比(bi)率)、總死細胞(bao)數量(濃度-比率(lv))

 

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